MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 7462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005824	TGAA	2	8	12	19	50 %	25 %	25 %	0 %	45655586
2	NC_005824	AAATC	2	10	67	76	60 %	20 %	0 %	20 %	45655586
3	NC_005824	TCAA	2	8	184	191	50 %	25 %	0 %	25 %	45655586
4	NC_005824	TTCA	2	8	199	206	25 %	50 %	0 %	25 %	45655586
5	NC_005824	T	7	7	224	230	0 %	100 %	0 %	0 %	45655586
6	NC_005824	A	6	6	316	321	100 %	0 %	0 %	0 %	45655586
7	NC_005824	TC	3	6	414	419	0 %	50 %	0 %	50 %	45655586
8	NC_005824	TGGT	2	8	524	531	0 %	50 %	50 %	0 %	45655586
9	NC_005824	GAA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655586
10	NC_005824	CCT	2	6	611	616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655586
11	NC_005824	T	7	7	638	644	0 %	100 %	0 %	0 %	45655586
12	NC_005824	TTA	2	6	662	667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655586
13	NC_005824	GAT	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655586
14	NC_005824	ATT	2	6	695	700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655586
15	NC_005824	GAA	2	6	702	707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655586
16	NC_005824	ACGT	2	8	763	770	25 %	25 %	25 %	25 %	45655586
17	NC_005824	AGTT	2	8	778	785	25 %	50 %	25 %	0 %	45655586
18	NC_005824	A	8	8	801	808	100 %	0 %	0 %	0 %	45655586
19	NC_005824	ACAA	2	8	876	883	75 %	0 %	0 %	25 %	45655586
20	NC_005824	GGTCT	2	10	922	931	0 %	40 %	40 %	20 %	45655586
21	NC_005824	TGC	2	6	968	973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655586
22	NC_005824	TCAA	2	8	977	984	50 %	25 %	0 %	25 %	45655586
23	NC_005824	CGGAGA	2	12	1040	1051	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	45655586
24	NC_005824	AAG	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655586
25	NC_005824	GGCT	2	8	1129	1136	0 %	25 %	50 %	25 %	45655586
26	NC_005824	ATG	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655586
27	NC_005824	ACG	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655586
28	NC_005824	A	6	6	1302	1307	100 %	0 %	0 %	0 %	45655586
29	NC_005824	GAT	2	6	1368	1373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655586
30	NC_005824	ACT	2	6	1392	1397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655586
31	NC_005824	A	6	6	1424	1429	100 %	0 %	0 %	0 %	45655586
32	NC_005824	GAA	2	6	1434	1439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655586
33	NC_005824	AAG	2	6	1537	1542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655586
34	NC_005824	GTT	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655586
35	NC_005824	GAC	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655586
36	NC_005824	TCC	3	9	1793	1801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655586
37	NC_005824	GAA	2	6	1825	1830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655586
38	NC_005824	GAG	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655586
39	NC_005824	TTC	3	9	1919	1927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655586
40	NC_005824	TGG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655586
41	NC_005824	CTT	2	6	2035	2040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655586
42	NC_005824	A	6	6	2120	2125	100 %	0 %	0 %	0 %	45655586
43	NC_005824	T	6	6	2145	2150	0 %	100 %	0 %	0 %	45655586
44	NC_005824	CGG	2	6	2269	2274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655586
45	NC_005824	CTT	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655586
46	NC_005824	CGG	2	6	2434	2439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655586
47	NC_005824	TTC	2	6	2512	2517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655586
48	NC_005824	AAT	2	6	2527	2532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655586
49	NC_005824	TCC	2	6	2604	2609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655587
50	NC_005824	ATT	2	6	2753	2758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655587
51	NC_005824	ATC	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655587
52	NC_005824	AGGAGA	2	12	2883	2894	50 %	0 %	50 %	0 %	45655587
53	NC_005824	A	6	6	2899	2904	100 %	0 %	0 %	0 %	45655587
54	NC_005824	GGT	2	6	2980	2985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655587
55	NC_005824	AGA	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655587
56	NC_005824	GACT	2	8	3063	3070	25 %	25 %	25 %	25 %	45655587
57	NC_005824	T	8	8	3086	3093	0 %	100 %	0 %	0 %	45655587
58	NC_005824	TTAG	2	8	3124	3131	25 %	50 %	25 %	0 %	45655587
59	NC_005824	CTT	2	6	3179	3184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655587
60	NC_005824	TC	3	6	3235	3240	0 %	50 %	0 %	50 %	45655587
61	NC_005824	AAG	2	6	3254	3259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655587
62	NC_005824	GAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655587
63	NC_005824	AGA	2	6	3286	3291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655587
64	NC_005824	AG	3	6	3319	3324	50 %	0 %	50 %	0 %	45655587
65	NC_005824	TCAA	2	8	3365	3372	50 %	25 %	0 %	25 %	45655587
66	NC_005824	TGT	2	6	3438	3443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005824	AATT	2	8	3483	3490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005824	AGT	2	6	3528	3533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005824	TGC	2	6	3543	3548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_005824	TAT	2	6	3577	3582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005824	TTTTG	2	10	3599	3608	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005824	T	6	6	3696	3701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005824	TAG	2	6	3800	3805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005824	T	6	6	3865	3870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005824	GAAA	2	8	3873	3880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005824	AT	3	6	3926	3931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005824	AGTT	2	8	3945	3952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005824	T	6	6	3961	3966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005824	GGA	2	6	4022	4027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005824	TTTG	2	8	4054	4061	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005824	TTCTTT	2	12	4073	4084	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	45655588
82	NC_005824	GGT	2	6	4089	4094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655588
83	NC_005824	A	6	6	4095	4100	100 %	0 %	0 %	0 %	45655588
84	NC_005824	GTAT	2	8	4237	4244	25 %	50 %	25 %	0 %	45655588
85	NC_005824	TCT	2	6	4254	4259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655588
86	NC_005824	TTCC	2	8	4310	4317	0 %	50 %	0 %	50 %	45655588
87	NC_005824	TC	3	6	4330	4335	0 %	50 %	0 %	50 %	45655588
88	NC_005824	TGT	2	6	4373	4378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655588
89	NC_005824	TTC	2	6	4379	4384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655588
90	NC_005824	CCA	2	6	4385	4390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45655588
91	NC_005824	TTC	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655588
92	NC_005824	AAG	2	6	4484	4489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655588
93	NC_005824	GAACCG	2	12	4510	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655588
94	NC_005824	AGA	2	6	4554	4559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655588
95	NC_005824	T	7	7	4591	4597	0 %	100 %	0 %	0 %	45655588
96	NC_005824	T	9	9	4615	4623	0 %	100 %	0 %	0 %	45655588
97	NC_005824	T	6	6	4625	4630	0 %	100 %	0 %	0 %	45655588
98	NC_005824	GAAA	2	8	4718	4725	75 %	0 %	25 %	0 %	45655588
99	NC_005824	GCT	2	6	4755	4760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655588
100	NC_005824	CGT	2	6	4777	4782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655588
101	NC_005824	TTC	2	6	4787	4792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655588
102	NC_005824	TGT	2	6	4823	4828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655588
103	NC_005824	GGT	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655588
104	NC_005824	T	6	6	4910	4915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005824	TCT	2	6	4933	4938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_005824	ATT	2	6	4943	4948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005824	T	6	6	4994	4999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005824	TTTAA	2	10	5009	5018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005824	TA	3	6	5083	5088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005824	TAC	2	6	5113	5118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_005824	A	6	6	5128	5133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005824	A	7	7	5177	5183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005824	A	6	6	5217	5222	100 %	0 %	0 %	0 %	45655589
114	NC_005824	TCT	2	6	5304	5309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655589
115	NC_005824	A	6	6	5348	5353	100 %	0 %	0 %	0 %	45655589
116	NC_005824	CAA	2	6	5435	5440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655589
117	NC_005824	AGAA	2	8	5471	5478	75 %	0 %	25 %	0 %	45655589
118	NC_005824	TTC	2	6	5518	5523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655589
119	NC_005824	CCT	2	6	5547	5552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655589
120	NC_005824	GAA	2	6	5574	5579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655589
121	NC_005824	ATT	2	6	5629	5634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655589
122	NC_005824	T	6	6	5672	5677	0 %	100 %	0 %	0 %	45655589
123	NC_005824	A	6	6	5692	5697	100 %	0 %	0 %	0 %	45655589
124	NC_005824	ATC	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655589
125	NC_005824	TTTC	2	8	5712	5719	0 %	75 %	0 %	25 %	45655589
126	NC_005824	A	6	6	5727	5732	100 %	0 %	0 %	0 %	45655589
127	NC_005824	TC	3	6	5763	5768	0 %	50 %	0 %	50 %	45655589
128	NC_005824	ATC	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655589
129	NC_005824	TTTC	2	8	5874	5881	0 %	75 %	0 %	25 %	45655589
130	NC_005824	TGGA	2	8	5893	5900	25 %	25 %	50 %	0 %	45655589
131	NC_005824	TTC	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655589
132	NC_005824	GAA	2	6	6033	6038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655589
133	NC_005824	T	6	6	6079	6084	0 %	100 %	0 %	0 %	45655589
134	NC_005824	AGA	2	6	6090	6095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655590
135	NC_005824	GCG	2	6	6100	6105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655590
136	NC_005824	AAC	2	6	6131	6136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655590
137	NC_005824	TCT	3	9	6142	6150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655590
138	NC_005824	AAT	2	6	6193	6198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655590
139	NC_005824	A	8	8	6201	6208	100 %	0 %	0 %	0 %	45655590
140	NC_005824	T	6	6	6318	6323	0 %	100 %	0 %	0 %	45655590
141	NC_005824	CTT	2	6	6336	6341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655590
142	NC_005824	CTC	2	6	6659	6664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655591
143	NC_005824	TC	3	6	6699	6704	0 %	50 %	0 %	50 %	45655591
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257	NC_005824	ATTTTT	2	12	12257	12268	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45655596
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261	NC_005824	TA	4	8	12419	12426	50 %	50 %	0 %	0 %	45655596
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263	NC_005824	AGG	2	6	12467	12472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655596
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265	NC_005824	T	6	6	12515	12520	0 %	100 %	0 %	0 %	45655596
266	NC_005824	GAAA	2	8	12528	12535	75 %	0 %	25 %	0 %	45655596
267	NC_005824	GAA	2	6	12579	12584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655596
268	NC_005824	GATCC	2	10	12662	12671	20 %	20 %	20 %	40 %	45655596
269	NC_005824	GAG	2	6	12676	12681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655596
270	NC_005824	GA	3	6	12721	12726	50 %	0 %	50 %	0 %	45655596
271	NC_005824	A	6	6	12755	12760	100 %	0 %	0 %	0 %	45655597
272	NC_005824	TCC	2	6	12762	12767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655597
273	NC_005824	GAT	2	6	12774	12779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655597
274	NC_005824	GAA	2	6	12838	12843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655597
275	NC_005824	TTTGAC	2	12	12898	12909	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45655597
276	NC_005824	T	6	6	12920	12925	0 %	100 %	0 %	0 %	45655597
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278	NC_005824	AAG	2	6	13072	13077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655597
279	NC_005824	GGT	2	6	13135	13140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655597
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413	NC_005824	GTT	2	6	18567	18572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655601
414	NC_005824	TCT	2	6	18581	18586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655601
415	NC_005824	T	7	7	18646	18652	0 %	100 %	0 %	0 %	45655601
416	NC_005824	TCT	2	6	18659	18664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655601
417	NC_005824	TGTAT	2	10	18671	18680	20 %	60 %	20 %	0 %	45655601
418	NC_005824	CCCTA	2	10	18703	18712	20 %	20 %	0 %	60 %	45655601
419	NC_005824	T	6	6	18763	18768	0 %	100 %	0 %	0 %	45655601
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422	NC_005824	AAAT	2	8	18968	18975	75 %	25 %	0 %	0 %	45655601
423	NC_005824	GAA	2	6	18980	18985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655601
424	NC_005824	CAA	2	6	19029	19034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655601
425	NC_005824	ATA	2	6	19100	19105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655601
426	NC_005824	TTA	2	6	19109	19114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655601
427	NC_005824	ACT	2	6	19177	19182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655601
428	NC_005824	T	7	7	19203	19209	0 %	100 %	0 %	0 %	45655601
429	NC_005824	AGC	2	6	19225	19230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655601
430	NC_005824	TTGT	2	8	19234	19241	0 %	75 %	25 %	0 %	45655601
431	NC_005824	CCT	2	6	19265	19270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655601
432	NC_005824	T	8	8	19314	19321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_005824	TGGAAG	2	12	19357	19368	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
434	NC_005824	GCC	2	6	19435	19440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
435	NC_005824	AAT	2	6	19532	19537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_005824	TGTCC	2	10	19815	19824	0 %	40 %	20 %	40 %	45655602
437	NC_005824	A	6	6	19825	19830	100 %	0 %	0 %	0 %	45655602
438	NC_005824	AAG	2	6	19840	19845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655602
439	NC_005824	CTATT	2	10	19933	19942	20 %	60 %	0 %	20 %	45655602
440	NC_005824	A	7	7	19944	19950	100 %	0 %	0 %	0 %	45655602
441	NC_005824	CCG	2	6	20016	20021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45655602
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443	NC_005824	TCT	2	6	20078	20083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655602
444	NC_005824	ATA	2	6	20174	20179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655602
445	NC_005824	TCG	2	6	20191	20196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655602
446	NC_005824	GGT	2	6	20279	20284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655602
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449	NC_005824	TTC	2	6	20440	20445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655602
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451	NC_005824	TGT	2	6	20469	20474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655602
452	NC_005824	T	6	6	20480	20485	0 %	100 %	0 %	0 %	45655602
453	NC_005824	A	7	7	20486	20492	100 %	0 %	0 %	0 %	45655602
454	NC_005824	TTC	2	6	20495	20500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655602
455	NC_005824	GGTTT	2	10	20532	20541	0 %	60 %	40 %	0 %	45655602
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458	NC_005824	GTTT	2	8	20619	20626	0 %	75 %	25 %	0 %	45655602
459	NC_005824	TAAATT	2	12	20648	20659	50 %	50 %	0 %	0 %	45655602
460	NC_005824	CGA	2	6	20662	20667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655602
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462	NC_005824	CCCTA	2	10	20730	20739	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
463	NC_005824	TTTGA	2	10	20786	20795	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
464	NC_005824	GT	4	8	20798	20805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
465	NC_005824	CAGA	2	8	20865	20872	50 %	0 %	25 %	25 %	45655603
466	NC_005824	GGAAAA	2	12	20947	20958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655603
467	NC_005824	A	6	6	20990	20995	100 %	0 %	0 %	0 %	45655603
468	NC_005824	AAAC	2	8	21001	21008	75 %	0 %	0 %	25 %	45655603
469	NC_005824	TAT	2	6	21021	21026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655603
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471	NC_005824	T	8	8	21152	21159	0 %	100 %	0 %	0 %	45655603
472	NC_005824	AGA	2	6	21201	21206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655603
473	NC_005824	GTT	2	6	21228	21233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655603
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477	NC_005824	AT	3	6	21363	21368	50 %	50 %	0 %	0 %	45655603
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479	NC_005824	CGC	2	6	21420	21425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45655603
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481	NC_005824	CG	3	6	21567	21572	0 %	0 %	50 %	50 %	45655603
482	NC_005824	TTAT	2	8	21629	21636	25 %	75 %	0 %	0 %	45655603
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500	NC_005824	G	7	7	22320	22326	0 %	0 %	100 %	0 %	45655604

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